良(liang)好(hao)水(shui)生(sheng)態(tai)系(xi)統的(de)(de)特(te)征具有生(sheng)物的(de)(de)多樣性。包括生(sheng)物基因的(de)(de)多樣性、生(sheng)物棲息(xi)地(di)的(de)(de)多樣性和(he)生(sheng)物物種的(de)(de)多樣性三(san)方面;水(shui)生(sheng)態(tai)系(xi)統的(de)(de)結構完(wan)整。水(shui)生(sheng)態(tai)系(xi)統結構指構成生(sheng)態(tai)系(xi)統諸要素及其(qi)量比關系(xi)，各組分在時間、空間上的(de)(de)分布，以及各組分之間的(de)(de)能量、物質(zhi)、信(xin)息(xi)的(de)(de)交流(liu)途徑與(yu)傳遞關系(xi)。

　　只有(you)結構(gou)完整(zheng)的系統才是穩定和(he)健康的生(sheng)態系統，主要表象(xiang)為生(sheng)物(wu)的生(sheng)產者(zhe)、消費者(zhe)和(he)分解者(zhe)齊全，各(ge)類生(sheng)物(wu)需要的能量、營(ying)養和(he)食物(wu)鏈結構(gou)完整(zheng)。外來物(wu)種少(shao)。特有(you)物(wu)種生(sheng)存良(liang)好(hao);水質良(liang)好(hao);景觀及環境優美，使人寧靜、陶醉、舒心，產生(sheng)靈(ling)感和(he)創作激(ji)情。

　　生態(tai)系統(tong)保護與(yu)治理(li)(li)原則由(you)于生態(tai)系統(tong)的(de)復雜性，到目(mu)前為止并(bing)沒有經典、統(tong)一(yi)和(he)定量化(hua)的(de)水生態(tai)系統(tong)保護與(yu)治理(li)(li)理(li)(li)論，但有幾(ji)個基(ji)本原則：需要按自然規律辦事，少(shao)干擾，不進一(yi)步破壞也是治理(li)(li)計劃(hua)。

　　水質良好是人類和生物都(dou)需要的，是生態治理(li)的基(ji)本(ben)內容;保(bao)(bao)護(hu)生態系統比保(bao)(bao)護(hu)旗艦(jian)物種更重要;生態系統結構和完整性的保(bao)(bao)護(hu)比物種數量(liang)或者生物量(liang)的保(bao)(bao)護(hu)更重要;治理生態系統(tong)的功(gong)能比治理景觀更重要。

　　生態系(xi)統治理的目標，是生態系統的結構和功能(neng)的治理，但也有以(yi)標(biao)志性物種(zhong)重現為目標(biao)：如萊茵河生態(tai)治(zhi)理計劃明(ming)確地把大馬哈(ha)魚回到(dao)河流作為其(qi)標志;英國泰(tai)晤士河治理(li)將大(da)馬哈魚(yu)、鱒魚(yu)、鰻魚(yu)等作為(wei)河(he)流生(sheng)態治(zhi)理(li)的(de)重(zhong)要成效(xiao)指標(biao);德國眾多河(he)流的(de)生(sheng)態治理也都把河(he)流系(xi)統(tong)(tong)中的(de)(de)(de)各種生(sheng)(sheng)物放(fang)在十分(fen)重要的(de)(de)(de)位置，將水體重建、河(he)流的(de)(de)(de)水文循環恢復、使魚類(lei)和底(di)棲無脊(ji)椎動(dong)物回到(dao)河(he)流以實現(xian)河(he)流生(sheng)(sheng)態系(xi)統(tong)(tong)完整性作為目標，德國Isar河(he)的(de)(de)(de)生(sheng)(sheng)態治理甚(shen)至(zhi)將在河流中游泳、洗浴作為治理(li)目標。

　　水生態(tai)系統(tong)的治理不僅在于水體和水底，更(geng)重要是治理水(shui)(shui)陸過(guo)度帶，控制點(dian)源和面源污染。水(shui)(shui)生態系統恢復(fu)的三(san)大任務(wu)是水(shui)(shui)質和自然水(shui)(shui)文過(guo)程的提(ti)高;水(shui)(shui)域形態及地貌特(te)征和生物(wu)物(wu)種的恢復(fu)。

　　治理的(de)方法(fa)包(bao)括物(wu)理(如棲息地)、化(hua)學(如水(shui)(shui)質)、生物(wu)和(he)(he)管理等多方面，重建或者調度比較自然的(de)水(shui)(shui)文和(he)(he)水(shui)(shui)動力過程(cheng)、恢復彎曲河道和(he)(he)分汊河道、增(zeng)加水(shui)(shui)面生態斑(ban)點和(he)(he)生態走廊就是物(wu)理方法(fa)，而曝氣復氧、添(tian)加活性炭(tan)等屬(shu)(shu)于(yu)化(hua)學方法(fa)，重建岸邊植被和(he)(he)水(shui)(shui)草、生物(wu)操作、增(zeng)殖放流(liu)等屬(shu)(shu)于(yu)生物(wu)方法(fa)。

　　水(shui)(shui)(shui)(shui)生(sheng)(sheng)態(tai)(tai)文(wen)明的(de)(de)基(ji)本特(te)征水(shui)(shui)(shui)(shui)生(sheng)(sheng)態(tai)(tai)文(wen)明定義(yi)(yi)可以(yi)分為廣(guang)義(yi)(yi)和(he)狹義(yi)(yi)兩種，前者包括(kuo)人(ren)水(shui)(shui)(shui)(shui)和(he)諧(xie)及水(shui)(shui)(shui)(shui)生(sheng)(sheng)態(tai)(tai)系(xi)統良好兩方面內(nei)容，而(er)狹義(yi)(yi)的(de)(de)定義(yi)(yi)主要指水(shui)(shui)(shui)(shui)生(sheng)(sheng)態(tai)(tai)系(xi)統良好一(yi)個(ge)方面。廣(guang)義(yi)(yi)水(shui)(shui)(shui)(shui)生(sheng)(sheng)態(tai)(tai)文(wen)明的(de)(de)基(ji)本特(te)征：1)在社會(hui)和(he)個(ge)人(ren)合理(li)承擔一(yi) 洪水(shui)(shui)(shui)(shui)風險的(de)(de)情況(kuang)下(xia)，保(bao)(bao)障江河(he)湖海水(shui)(shui)(shui)(shui)域(yu)的(de)(de)防洪，特(te)別(bie)強(qiang)(qiang)調(diao)保(bao)(bao)障人(ren)民生(sheng)(sheng)命和(he)財產(chan);2)在考慮節約用水(shui)(shui)(shui)(shui)等嚴格(ge)水(shui)(shui)(shui)(shui)資源管(guan)理(li)條件下(xia)，保(bao)(bao)障人(ren)類(lei)用水(shui)(shui)(shui)(shui)，特(te)別(bie)強(qiang)(qiang)調(diao)人(ren)畜飲用水(shui)(shui)(shui)(shui)保(bao)(bao)障;3)為了人(ren)類(lei)可持續發展，盡(jin)量保(bao)(bao)障水(shui)(shui)(shui)(shui)域(yu)生(sheng)(sheng)態(tai)(tai)系(xi)統良好，不(bu)僅(jin)要保(bao)(bao)障水(shui)(shui)(shui)(shui)域(yu)水(shui)(shui)(shui)(shui)質(zhi)良好，還(huan)要為特(te)有水(shui)(shui)(shui)(shui)生(sheng)(sheng)生(sheng)(sheng)物提供基(ji)本的(de)(de)棲息(xi)地(di)及水(shui)(shui)(shui)(shui)環(huan)境條件。